Santorini je jeden z nejjižnějších ostrovů souostroví Kyklad v Egejském moři.
Jeho vzdálenost od přístavu Piraeus v Athénách je 240 km, od Heraklionu na Krétě 128 km a od ostrova Rhodos 235 km. Ostrov je obvykle nazýván Santorini, ale jeho oficiální jméno je Thera a Thera se jmenuje také hlavní město stejnojmenného administrativního celku v rámci provincie Kyklady.
Pobřeží ostrova je asi 70km dlouhé.
Celá skupina sestává z hlavního a největšího ostrova Santorini, nazývaného také Thera ve tvaru podkovy, menšího ostrova Therasia severovýchodně od Théry a ještě menšího neobydleného ostrůvku Aspronisi uprostřed otevřené "podkovy" směrem k Egejskému moři. Navíc jsou zde ještě tři malé vulkanické ostrůvky kuželovitého tvaru uvnitř velké zátoky, jmenovitě Palia Kaméni, Néa Kaméni a Mikri Kaméni. Od nejsevernějšího bodu k nejjižnějšímu je vzdálenost cca 18 km. Šířka kolísá mezi 2 a 6 km. Nejvyššími horami jsou Profitis Ilias (567 m n.m.), Megalo Vounó ( 353 m n.m.) a Mikros Profitis Ilias (337m n.m.) a kromě nich je zde řada menších vrchů.